Santa Cruz ha formado parte de 7 equipos donde su mayor estancia deportiva ha sido a nivel europeo, su palmarés fueron estando en el Bayern Múnich (8 temporadas) ganando la UEFA Champions League 2000-01, 5 Bundesligas, 4 Copas de Alemania, 1 Copa Intercontinental y un Mundial de Clubes, además ganó el Clausura con el equipo donde debutó, el Olimpia. El equipo que ganó este campeonato fue el que produjo el surgimiento del apodo de los “Diablos Rojos”; este mote surgió del periodista Hugo Marini, camiseta manchester united 2022 del diario Crítica.